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Edité par Université de Rouen

Le projet GENOSOIL avait pour objectif principal de développer une méthode de quantification de la biodiversité du sol se basant sur une combinaison d’approches de taxonomie moléculaire mettant en oeuvre le barcode ADN et la métagénomique (barcode environnemental à partir d’échantillons totaux d’invertébrés et/ou d’échantillons de sol). La démarche s’appuie sur : - la constitution de bibliothèques de référence de barcodes ADN, - l’utilisation des outils de séquençage de nouvelle génération (Roche 454, Illumina MiSeq) pour caractériser les communautés d’invertébrés présentes dans des échantillons de sol ou issus d’extraction de faune. L’élaboration et la calibration du protocole ont été faites à l’aide d’échantillons d’invertébrés et de sols prélevés dans différents gradients environnementaux caractéristiques des écosystèmes du Nord-Ouest de la France.

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