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GENOSOIL. Approche métagénomique pour l’étude de la biodiversité totale du sol. 5 mars 2014. (Metagenomic insignts into the study of total biodiversity of soils). A - Rapport final.- 84 p. B - Synthèse du rapport final.- 14 p.

Livre

DECAENS (Thibaud) | UNIVERSITE Rouen | LABORATOIRE ETUDE ET COMPREHENSION DE LA BIODIVERSITE | LABORATOIRE MORPHODYNAMIQUE CONTINENTALE ET COTIERE | UMR BIOGEOCHIMIE ET ECOLOGIE DES MILIEUX CONTINENTAUX. | CENTRE DE BIOLOGIE POUR LA GESTION DES POPULATIONS | UMR ORIGINE STRUCTURE ET EVOLUTION DE LA BIODIVERSITE | LABORATOIRE LETG Rennes Costel | CANADA Université Guelph | LABORATOIRE D'ECOLOGIE DES HYDROSYSTEMES NATURELS ET ANTHROPISES | UR PHYSICOCHIMIE ET ECOTOXICOLOGIE DES SOLS D'AGROSYSTEMES CONTAMINES

Edité par Université de Rouen. Rouen - 2014

Date de publication : 01/01/2014

Le projet GENOSOIL avait pour objectif principal de développer une méthode de quantification de la biodiversité du sol se basant sur une combinaison d’approches de taxonomie moléculaire mettant en oeuvre le barcode ADN et la métagénomique (barcode environnemental à partir d’échantillons totaux d’invertébrés et/ou d’échantillons de sol). La démarche s’appuie sur : - la constitution de bibliothèques de référence de barcodes ADN, - l’utilisation des outils de séquençage de nouvelle génération (Roche 454, Illumina MiSeq) pour caractériser les communautés d’invertébrés présentes dans des échantillons de sol ou issus d’extraction de faune. L’élaboration et la calibration du protocole ont été faites à l’aide d’échantillons d’invertébrés et de sols prélevés dans différents gradients environnementaux caractéristiques des écosystèmes du Nord-Ouest de la France.