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Le calcul de l’indicateur angiospermes dans la masse d’eau FRFC06 – Arcachon amont est basé sur le suivi de trois métriques (composition, extension, abondance) des deux espèces de zostères présentes dans la Baie : Zostera noltei et Zostera marina. Les résultats obtenus jusqu’en 2018 permettent d’affecter une qualité « moyenne » à cette masse d’eau vis-à-vis de cet indicateur, qui est, pour l’instant la seule à ne pas s’avérer en bon ou très bon état sur le littoral Manche-Atlantique français. Ce mauvais classement s’explique principalement par le fait que les emprises des deux espèces sont actuellement beaucoup plus faibles que celles, historiques, utilisées comme référence.