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Elleboode, Romain | Bled--defruit, Geoffrey | Guerinel, Anais | Telliez, Solene

This document provides instructions to use the Otolith Analysis plugins for the Icy software.Plugins have been developed by Icy Services for the Laboratoire de Ressources Halieutiques de Boulogne (PDG-RBE-HMMN-LRHBL), IFREMER, Boulogne-sur-Mer. This is a Java plugin running on the bioimage analysis software Icy. This plugin is composed of three modules: pre-processing of mosaic images, otolith shape analysis and otolith texture analysis (semiautomatic detection of increments for ageing measurements).   . Ce document fournit des instructions pour l'utilisation de plugins d'analyses des otolithes pour le logiciel Icy. Les plugins ont été développés par Icy Services pour le compte du Laboratoire de Ressources Halieutiques de Boulogne (PDG-RBE-HMMN-LRHBL), IFREMER, Boulogne-sur-Mer. Il s'agit d'un plugin Java plugin fonctionnant sur le logiciel d'analyse de bioimage Icy. Ce plugin est composé de trois modules : le prétraitement des images en mosaïque, l'analyse de la forme des otolithes et l'analyse de la texture des otolithes (de façon semi-automatique détection semi-automatique des incréments pour les mesures de vieillissement).  

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