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Missions, expertises, participations à des réunions et visio-conférences, travaux collaboratifs et échanges se sont succédé pendant l'année 2011 entre les experts de métropole et les correspondants dans les DOMs. Une mission, qui a eu lieu aux Antilles en mars 2011, ainsi que la participation aux COPILs de Guadeloupe et de Martinique fin 2011, ont permis d'échanger sur les résultats du suivi et des évaluations provisoires de l’état des masses d'eau, de proposer les ajustements nécessaires, et de préparer l'intégration des données DCE dans Quadrige². Une proposition écrite pour l'amélioration du plan de surveillance 2012 en Martinique a également été faite, suivie d'effet. A La Réunion, l'expertise étant assurée par la station Ifremer locale, les contacts entre les experts de métropole et La Réunion ont essentiellement porté sur les évaluations assurées par l'outil développé en métropole par Ifremer. Les études spécifiques sur le phytoplancton menées dans les DOMs ont permis l'acquisition de premières connaissances sur l'écologie du phytoplancton. Au vu des informations disponibles, les indices DCE développés pour la métropole doivent être adaptés aux eaux côtières oligotrophes des Antilles et de la Réunion et des grilles ont été proposées. Par ailleurs, les eaux côtières de Guyane subissant une influence importante des apports des estuaires locaux et des apports amazoniens présentent des caractéristiques les assimilant en partie aux eaux estuariennes. Les résultats d’une étude réalisée à partir des premières données de mise en place de la DCE en Martinique pourraient permettre d’avancer sur les pistes d’un indice abondance amélioré, et même d’un indice composition, à partir des analyses des communautés micro, pico- et nano-planctoniques, avec dénombrements classiques au microscope, et mesures en cytométrie en flux. Pour ces dernières, il apparait nécessaire d'acquérir des données supplémentaires pour pouvoir trouver les bonnes grilles de lecture. La priorité est clairement de progresser dans la connaissance de l'écologie du phytoplancton dans les systèmes tropicaux et pour progresser dans cette connaissance, il est nécessaire de disposer de données supplémentaires qui soient fiables pour une bonne exploitation des résultats. Au vu des difficultés rencontrées, les efforts doivent être portés sur les trois postes suivants : vigilance sur les méthodes de prélèvement et d'analyse, poursuite de la bancarisation, acquisition de données supplémentaires. Les perspectives et propositions pour le moyen terme sont les suivantes : les analyses du nano- et du pico-phytoplancton pourraient notamment être mises en oeuvre à haute résolution spatio-temporelle grâce à l’application en routine de la cytométrie en flux et l’utilisation de techniques comme les analyses pigmentaires par HPLC. Et d'autres techniques innovantes peuvent être envisagées telles celles testées actuellement en métropole dans le cadre du projet NTERREG DYMAPHY (cytométrie en flux de type Cyto Sense, fluorescence totale ou spectrale à haute résolution temporelle, images satellitales) de même que l’analyse d’image (FlowCAM / PhytoImage). En Guyane, la définition de grilles spécifiques à ce département devrait se baser, en complément des études IRD 2011 sur l'exploitation des données collectées dans le cadre de travaux doctoraux (do Rosario Marinho - Jaussaud, 2007) et de missions ultérieures sur la zone (CNRS – LOG Wimereux, ainsi que des pistes évoquées pour la définition d’indicateurs phytoplanctoniques en milieux estuariens (Caffier & Artigas 2010).
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