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Développement d'une méthode d'inventaire des communautés de poissons de Guyane par metabarcoding (ADN environnemental)

Livre

BROSSE (Sébastien) | CANTERA Isabel | CILLEROS Kévin | DIRECTION DE L'ENVIRONNEMENT, DE L'AMENAGEMENT ET DU LOGEMENT GUYANE | OFFICE DE L'EAU GUYANE | UNIVERSITE DE TOULOUSE III PAUL SABATIER

Edité par DEAL GUYANE - 2018

Date de publication : 01/04/2018

Les travaux menés jusqu'à présent sur les communautés de poissons de Guyane utilisent différentes méthodes d’échantillonnage en fonction des milieux prospectés. Ces techniques d’échantillonnage sont connues pour être destructives pour les poissons et présentent différents biais qui limitent la qualité des inventaires obtenus. Le développement récent des méthodes de metabarcoding environnemental (ou eDNA metabarcoding, Taberlet et al. 2012) pourrait constituer un moyen efficace pour contourner ces difficultés d'échantillonnage, puisque la méthode consiste à détecter l’ADN des organismes se trouvant dans l’eau et est donc théoriquement applicable sur toutes les masses d’eau (Rees et al. 2014). Ce rapport final présente les conclusions suites au développement de cet inventaire en Guyane.